一、根據國家科技發展規劃中的醫學科學技術研究的重點領域，結合醫療衛生工作和學科發展的實際需要，以防治危害人民健康的常見病、多發病為重點，選擇、安排課題。
二、以應用研究為主，重視基礎理論研究，加強技術開發研究，強化推廣應用意識，重點安排經濟效益或社會效益較大的項目。
三、重點扶持和發展醫院的優勢學科，形成特色。
四、鼓勵開展橫向課題，加強與社會各界的合作，鼓勵開展交叉、邊緣、新興學科課題；提倡多學科大力協作攻關。
五、鼓勵開展軟科學研究、社會科學研究和教學研究。
六、申請列入計劃的科研項目必須具備下列條件：
（一）先進性 選題內容新穎，有創新，研究起點高，有一定技術難度，選用指標先進，預計研究結果可達到國內先進水平或以上。
（二）科學性 對國內外發展趨勢和動態比較熟悉和了解，立題有充足的依據，課題設計嚴密細致，研究內容、指標具體，研究手段與方法先進合理，技術路線周密清晰可行，試驗動物、受試對象樣本量能滿足統計學要求。
（三）適用性 目的明確，具有特色。應用研究和發展研究具有良好的應用前景，能取得明顯的社會效益和經濟效益。基礎研究項目具有較高的理論水平與學術價值，有可預見的應用前景，對推動科技進步具有價值。
（四）可行性 有一定的研究工作基礎，具備基本的實驗條件，儀器設備、所需動物、試劑藥品供應有保證，課題組人員組成已落實，有承擔并完成所申請項目的能力，協作單位已落實，協作內容有明確分工。研究進度切合實際，教學科研統籌安排，研究時間有保證。
七、凡列入計劃的項目，課題組必須按計劃規定的內容、指標及進度實施，項目一般實行課題組長負責制。
八、科研項目的實施和執行情況一般每半年進行一次大檢查，檢查中發現的問題應及時進行處理和幫助解決。各課題組每半年進行一次研究進展情況小結，并填寫《科研計劃項目進度情況表》。
九、在計劃執行期間，研究課題人員要保持相對穩定，不得隨意改做其它工作，科研計劃項目完成后，應整理全部資料寫出技術鑒定大綱、研究工作報告、技術報告、有關的測試報告、應用推廣情況報告、查新檢索等材料打印好后，連同填寫的《科研成果鑒定（評議申請書）》報計劃下達科研組或主管部門審查同意后，組織鑒定、語言或驗收。不具備鑒定或評議條件的項目也必須寫出總結報告上報科研組入檔。
十、課題鑒定或評議后，應按國家《科學技術檔案工作辦法》將試驗數據、照片、圖表、文字資料等整理立卷入檔。
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